La porte intérieure a été construite par Darius 1er, comme l'indique une inscription à l'intérieur. Elle est reliée à la porte principale par une longue allée.  Elle constituait l'ouverture d'une grande enceinte en briques. Les façades et l'intérieur sont décorés. Deux grandes scènes d'offrandes avec Darius et Amon-Rê d'Hibis ornent les parois intérieures. Le plafond montre 5 vautours très colorés.
Entre cette porte et le portique, exactement à mi-chemin entre les 2, l'existence de deux bases de 2 mètres de côté laisse à penser qu'elles supportaient 2 obélisques, probablement de Nectanebo au vu leurs positions médianes. (Part I, p.34 et 35).