Le temple de Khonsou est situé dans la partie Sud-Ouest du grand temple d'Amon à Karnak.  Son axe d'orientation court du Sud au Nord, pzrpzndiculaire ç l'axe du temple d'Opet qui se trouve à côté. Une ouverture dans la première court du temple de Khonsou permettait d'accéder directement à la face arrière du temple d'Opet où se trouve une chapelle dédiée à Osiris.
La constructiuion et la décoration du temple de Khonsou s'est étendue sur pratiquement un millénaire, depuis Ramsès III jusqu'à Ptolémée Évergète I. Eamsès IV et Ramsès XI y ont largement participé, ainsi que les grands prêtres thébains. Des cartouuches de nectanebo et d'Alexandre y sont également apposés.
Le temple proprement dit comporte un ptlône, une grande cour pértstyle avec un portique, une salle hypostyle, le sanctuaire de la barque et une salle avec un reposoir de barque. Des chapelles entourent ces deux dernières salles.